氢分子可以通过氢气吸入、饮用富氢水、富氢水沐浴、口服产氢药物或氢水面膜等方式进入机体，弥散到各内脏器官。国内外许多种疾病的动物模型实验中都已观察到其干预效果。
1. 氢气吸入
氢气可以在通风环境下以安全的浓度（4%以下或75%以上）使用，借助氢气浓度监测仪，可以较容易地控制氢气的浓度。目前可利用电解水生成氢气装置，通过面罩或鼻导管为患者提供氢气。
目前市面上销售的氢气呼吸机流量有:300/600ml
2007年日本医科大学报道了对脑血栓大鼠施用浓度为2%的氢气干预，发现脑缺血损伤的体积显著减少。他们还报道了用2%浓度的氢气治疗大鼠心肌缺血的实验，结果显示氢分子降低了缺血性心脏病的发生率。
在肺的缺血再灌注损伤、失血性休克和高氧肺损伤等疾病动物模型实验中也都可以看到氢气调节的有效性。
2008年，美国匹兹堡大学医学中心给小鼠用面罩吸入2%浓度的氢气，发现该做法可减缓移植物诱导的炎症介质白细胞介素（interleukin，1L）-1β、1L-6和肿瘤坏死因子 (tumor necrosis factorTNF)-a的上调，显著降低脂质过氧化及中性粒细胞募集。
2019年，日本千叶大学医学院研究了大鼠持续吸入3%浓度的氢气后体内氢气的分布情况，发现氢气可以快速且自由地扩散到各脏器中，5分钟左右在大鼠肝和脑中的浓度达到峰值。
2. 饮用富氢水
富氢水制备方便且安全性高，便于临床应用及推广。
目前常用的制备方法有以下4种：
①电解法：通过电解水，同时产生氢气与氧气，通常氢气在水中的饱和浓度大约为1.6毫克/升。
②镁滤芯制氢：在滤芯中加入金属镁，当水流过滤芯时，经置换反应产生氢气。不过，随着使用次数增加，滤芯被氧化，其制氢能力会下降。
③氢棒制氢：基本原理同镁滤芯制氢，使氢棒(含金属镁)与水在密闭容器中反应，氢棒周围产生氢气，但多次使用会因镁被氧化而使效果下降。
④高压溶解法：使用高压和特殊工艺将高浓度的氢气溶解在水中并密封保存，高压下氢气在水中的浓度可达3毫克/升以上。
与其他摄入氢气模式相比，饮用富氢水可显著增加胃肠道系统局部的氢气浓度，可能更适用于胃肠道疾病的相关研究。
2009年美国波士顿福赛斯研究所报道，给患有炎症性肠病的小鼠饮用富氢水，其肠道炎症得到明显改善。
2009年日本九州大学报道，通过让小鼠饮用富氢水成功地减轻了药物诱发的帕金森病的症状。
2010年美国匹兹堡大学报道，让肾脏移植后的小鼠每天饮用富氢水，可保持其肾功能并预防慢性排斥反应的发生。
2012年日本冈山大学发现，在非酒精性脂肪性肝炎-肝细胞癌小鼠模型中，饮用富氢水可降低肝癌的发生概率。
另外还有研究表明，饮用富氢水对缓解大鼠牙周组织衰老也有一定的帮助作用。
3.富氢水沐浴
沐浴装置一般采用电解水方式制得氢水。
2013年韩国延世大学首次研究了富氢水沐浴对皮肤光损伤的影响。无毛小鼠接受累计照射剂量为每平方厘米360~540毫焦耳的紫外线照射后会出现皮肤损伤，给这些光损伤的小鼠进行富氢水沐浴，每天2次， 每次50分钟。结果发现，富氢水可改善小鼠的皮损情况，降低炎性细胞因子水平，减少皮肤扫描电镜下的皮肤角质形成细胞缺陷和超微结构改变。
2011年美国匹兹堡大学在大鼠实验中发现，用富氢保存液对供体小肠进行低温浸泡，可显著减少移植后小肠的缺血再灌注损伤。
另外在啮齿类动物心脏移植研究中发现用低温富氢器官保存液保存供体心脏，可有效改善移植后缺血再灌注导致的心肌损伤。
2019年日本熊本大学发现，富含氢的器官保存液可降低大鼠移植肝的氧化应激损伤及肝细胞凋亡，能延长移植物保存时间，改善移植物功能。
2017年日本名古屋大学发现，在大鼠肺缺血期间灌注富氢盐水溶液至左胸腔，可使肺功能显著提升，而促炎因子水平显著降低。
4. 口服产氢药物或氢诱导剂
口服产氢药物或氢诱导剂氢化珊瑚钙是采用固态氢化技术生产的一种负氢离子粉末，遇水后会缓慢释放出氢。负氢离子粉末是一种强还原剂，有明显的抗氧化作用。
2010年日本宫崎大学发现，给小鼠喂食氢化珊瑚钙可以增强小鼠大脑海马内源性抗氧化能力。
2016年，我国西安交通大学的生命科学与技术学院通过建立小鼠衰老模型，连续30天使小鼠口服氢化珊瑚钙，发现其能够提高小鼠组织抗氧化能力。
乳果糖是一种有效的氢诱导剂，可促进结肠菌群的消化和糖酵解，进而显著增加肠道内氢的产生量。
2013年我国海军军医大学长海医院报道，通过口服乳果糖可以减轻大鼠的脑缺血再灌注损伤，缓解由右旋糖酐硫酸钠诱发的小鼠结肠炎。
2015年我国浙江大学绍兴医院发现，口服乳果糖可以促进肝切除后大鼠肝脏的再生。
5. 氢水面膜
氢气面膜是指含有氢分子的面膜，在日韩也称为水素水面膜，通过敷面膜的方法缓慢地释放出氢，来达到美容的作用，与传统的面膜的区别在于氢气面膜添加了氢分子，氢分子融入到面膜，是需要先进的技术才能实现，对生产环境和生产要求也比较严格。
这些可能都是通过增加内源性氢气的产生量发挥作用。一般来看，常见的氢摄入分为“吸氢气”和“喝氢水”和“氢水沐浴”，这三种方式有各自不同作用特点，对于有长期慢性疾病以及想调节机体亚健康状态，三管齐下，应该是效率最高作用最全面的组合。
