氢气医学效应是最近才发现的，具体说是2007年才被日本学者发现的。更严格说，1975年就有美国科学家证明了高压氢气具有改善皮肤癌症的作用，距今也有45年了，所以氢气医学效应的发现并不是最近才发现。这个问题更准确的表达也许是，小剂量氢气的医学效应为什么最近才被发现。
这个问题背后的真正含义是，那么多聪明的大牛学者，氢气又是比较重要的气体，也是被充分研究的气体，为什么就没有人发现其医学效应。所以说，这个问题对氢气医学效应是否真实的另外一种表达方法。
严格意义上，即使小剂量氢气的效应也不是最近才发现，如果把电解水效应算上，60年前就有人证明电解水的作用，今天我们已经证明电解水的作用基础主要就是因为含有氢气。2007年只是证明这种效应的基础是氢气的作用，所以这种作用或现象早就被人开始研究，只是没有找到正确的答案。电解水会产生氢气，而具有疾病改善作用的电解水恰好是产生氢气的阴极，为什么早期研究忽视了氢气?我认为有两个原因，一是氢气是相对比较惰性的气体，其活性似乎不足以能产生生物效应，二是氢气非常难溶解于水，电解过程氢气大部分以气泡形式释放出来。估计活性小，推测剂量低，这可能是被长期忽视的原因。特别诡异的是，1997年著名电解水研究学者白钿教授对电解水具有抗氧化作用的研究中，采用氢气溶解水作为对照，竟然没有发现氢气的效应。这是非常令人遗憾的。
1975年高压氢气改善癌症的研究，虽然本质上是氢气的医学作用，但这种作用需要的高压氢气条件，是很难被临床医学应用接受的方法，不仅操作困难，而且非常危险。所以这个研究不仅不利于氢气医学效应的发现，可能对后来的研究产生负面作用，既然没有应用价值，且研究条件要求高，又有很大风险，这样的研究就没什么研究意思了。
氢气是一种典型的生物学气体，在高等生物系统的地位比较低可能是被忽视的原因。说一种物质是一种生物分子，是根据这种物质是生物能制造，并对生物产生一定影响的物质。多种多样的代谢物也是典型的生物分子。例如各种有机物，如蛋白质、核酸、糖、小肽、氨基酸、核苷酸、各种有机酸，生物体内产生的生物分子是一个十分庞大的群体。代谢组学是一种专门研究代谢分子的研究工具。采用组学方法研究也说明代谢物的复杂性，人们很难对单个分子进行全面的功能解析，还存在大量生物分子的功能不被人们了解。氢气虽然被深入研究，但是这种分子由于分子体积小，扩散能力强，一般的研究方法很难保证准确分析，如果不进行专门研究，甚至识别和分析都很困难。这也见于其他生物气体分子，例如一氧化氮研究首先发现“来自血管内皮细胞能扩张血管活性的物质”，许多年后才追踪到一氧化氮分子是产生这种效应的基础。对一氧化碳和硫化氢的研究则主要是参考了一氧化氮的研究主动去寻找的。这些生物分子的发现也都是比较晚近的事，而这些气体相对比氢气更容易发现。一是这些经典气体分子的生理功能强，例如一氧化氮是血压、免疫和神经系统功能的基本调节分子，正常生理功能不能离开这些分子的存在。许多细菌能合成氢气，也有细菌能利用氢气。至少在细菌层面，氢气也是典型的生物气体。不过氢气的生物学地位没有达到上述生物气体的境界，至少目前都未发现氢气对生物体不可或缺的生理功能。所以长期被忽视的一个重要原因是氢气生物学地位比较低。
从生物进化角度，氢气有比较高的生物地位，例如氢原子是组成有机物基本成分，氢气是复杂生物分子进化的关键原料，氢气对真核生物的进化也可能具有重要作用。今天的低等生物，氢气仍然具有代谢核心地位，许多原生生物都具有合成氢气的能力，也有许多低等生物具有利用氢气的能力。其中比较典型的就是多种生物包括人类的肠道内细菌，不仅存在大量能合成氢气的细菌，也有多种能利用氢气的细菌如产甲烷菌和硫化菌。
