最早的氢气医学效应研究论文见于1975年《科学》杂志，美国贝勒大学的学者报道，连续14天暴露在8个大气压氢气中对皮肤鳞状细胞癌有改善作用。2001年，法国科学家证明同样压强的氢气对血吸虫感染引起的肝炎具有改善作用。可能因为氢气有爆炸风险，高压氢气实验的操作难度大且很难在临床医学采用，这些研究没有引起医学界的重视。
早期高压氢气医学研究没有引起人们对氢气改善人类疾病可能性的关注，在潜水医学领域氢气也一直被作为生理惰性气体看待。直到2007年，日本医科大学老年和发育研究所太田成男教授课题组经过潜心研究，证明大鼠吸入氢气(2%，35分钟)可以改善脑缺血再灌注损伤，相关研究结果以长篇论著形式发表在世界著名杂志《自然医学》上。随后他们又证明吸入2%的氢气对肝脏和心肌缺血再灌注损伤有改善作用，这些研究结果提示氢气有可能作为干预手段应用于临床疾病的改善，氢气医学效应的潜在应用前景才真正受到重视。
虽然1975年就有学者开展氢气改善癌症的研究，但当时采用连续吸入8个大气压的高压氢气。2007年日本学者的研究是采用吸入35分钟0.01~0.04个大气压的氢气，两种剂量相差数十万倍，完全不可同日而语。因此，学界公认2007年日本的氢气医学研究是氢气医学研究的奠基性工作。
