分子氢对动脉粥样硬化的改善和预防作用，清除自由基、抗氧化被认为是防治动脉粥样硬化和心血管疾病的一项重要措施。分子氢具有清除自由基和抗氧化应激反应的优点，兼有降低血浆总胆固醇、甘油三酯和低密度脂蛋白，抗炎症和稳定已经形成的动脉硬化斑块等作用，从而可以减缓动脉粥样硬化的进展。
泰山医学院动脉粥样硬化研究所所长秦树存教授带领的团队在这方面作了深入研究，他们在动物实验基础上开展人体双盲对照临床研究，发现连续应用分子氢水2个月，可以调节血脂，提高患者高密度脂蛋白，降低低密度脂蛋白，提示分子具有防治人类动脉粥样硬化和血脂异常的作用，相关研究成果曾获得山东省科技进步二等奖，丰富了分子氢养生保健的科学依据。
国外进行的临床试验也证明，饮用饱和氢气生理盐水可以减少氧化性脂质的产生。另外，饮用饱和氢气生理盐水也可以降低动脉内的氧化应激水平，减少粥样硬化病变处的巨噬细胞聚集。在动原粥释硬化的动物模型中氢气可能在基因和蛋白质水平通过抑制促炎症反应基因的核转录因子的活化，从而减轻动脉粥样硬化的发生。这些实验研究和临床观察结果，为应用分子氢预防和改善动脉粥样硬化提供了理论依据。
注：分子氢清除血管内的自由基及其他垃圾，使血管通畅
