日本氢气医学研究起源于电解水效应本质的探索。我认为这才是真正符合学术逻辑的故事。
电解水的研究历史已经有一个世纪。日本学者西斯龙(synnohl据说是中文“神农氏”的意思)电机公司电机医学研究员诹访方季(Machisu Suwa)是电解水的创始人，他参考前苏联1920年前后关于水电解的研究资料，他从关注水电之间关系开始，于1931年他开始开展电解碱性离子水对动物植物影响的研究。1952年开发出自己的电解水技术，这种电解水设备将阳极和阴极用离子膜隔为双槽，能同时获得碱性和酸性电解水。此后诹访元先生多次对日本全国各个地区的水质进行了全面调查，使用不同地区的水分别进行电解研究，比较这些水电解后效应的差别。在诹访方季的持续努力下，与东京大学Akiba教授合作从1954年开始电解水首先应用在农业，1960年开始作为健康促进水用于医疗，1966年日本卫生、劳动和福利省同意电解还原水对慢性腹泻、消化不良、胃肠道异常发酵、抗酸剂、胃酸过多，并授权一类家用电解水机。
70年代后，关于电解水各种研究报告发表，许多学会协会相继建立，关于饮水和健康的关系受到广泛重视，电解水的作用也逐渐被日本社会接受认可。1992年6月。碱性离子水被一家电视新闻节目介绍为“神水” "Wonder water"，在这个节目中，碱性离子水用于医院内改善疾病，这些作用超过被认定的范围，例如能改善糖尿病等，这些作用报道来自医疗机构，此后出现一波探索电解水更多种医疗作用的趋势。
为了避免这种夸大趋势，日本家用健康设备工业协会2部所有生产和销售碱性离子水机的企业，于1992年9月成立碱性离子水设备协会。该协会目的是指导民众判断关于电解水的准确信息和规范应用，以利用这种方法获得健康生活质量。
电解水机被社会认可但作用逐渐被夸大，1992年12月，日本国家消费者事务中心对大众媒体关于电解水的报道提出质疑。1993年3月26日这以议题被日本公益委员会的《日本膳食》再次提出。日本厚生省要求相关企业提供关于电解水质量、效果和安全性等方面的科学证据。碱性离子水设备协会接受了这一要求，1993年2月任命了碱性电解水审查委员会，委员会主席是京都大学Itokawa教授，委员会用最新科学证据对电解水活性、安全性和有效性分别进行调查。
1994年委员会提交一份报告确认电解水的安全性，1997年提交了关于电解水对胃肠道疾病的有效性报告。
根据这些研究结果，协会通过修改电解水机标准进一步提高了设备要求。1999年在25届日本医学会年会上，调查委员会发表了"Electrolytic Functional Water in Medical Treatment"报告，这是国际第一篇对电解水开展的双盲对照临床试验报告，证明了碱性电解水有效性。
1994年在电解水应用比较火热的时期，在日本厚生省支持下成立“功能水基金会”。1999年Hayakawa报道给大鼠连续8周饮用碱性离子水能显著降低断链脂肪酸，但对粪便肠道菌没有影响。pH10碱性还原水对大鼠肠道内负ORP电位有明显影响，上述会议报道的1996年1月-1999年1月期间一项双盲安慰剂对照试验对电解水安全性进行评估，受试者主要包括烧心、烦躁不安、腹胀、慢性腹泻和便秘。安慰剂对照水是用自来水活性炭过滤，实验组用这种水的电解水。受试者实验组84人，对照组79人。连续14天每个人饮用水量每天至少500毫升。
结果显示碱性离子水能显著改善腹部不适。特别是慢性腹泻患者改善率高达94.1%，对照组只有64.7% (Tashiro, 2000)。
上世纪末到本世纪初，日本学者对电解水抗氧化，改善糖尿病、癌症和抗衰老等效应进行了部分基础和临床研究。总体来说，关于电解水医学效应的研究规模比较小，主要是围绕抗氧化等效应的观察性研究。在人体试验方面多属于个案观察，其中比较多的是关于改善体质、皮肤美容、降低糖尿病血糖水平甚至抗癌症作用。所有这些研究和案例中，缺乏非常严谨的逻辑证据和科学研究，导致电解水的研究一直没有得到学术界的广泛接受和认可。
总之，日本电解水医学的研究历史很长，也看到一些效应，但研究深度不够，没有被学术界普遍认可。但是，一些关于电解水疗效的数据显然不能完全被忽视。例如2005年MiZ公司报道电解水一直肝脏氧化损伤 (Yanagihara et al. 2005)。在这篇文章中也提出氢气可能是电解水效应的基础。
日本医科大学太田成男教授对电解水的研究进行了连续几年跟踪了解，最后决定研究这一现象。这是一个致力于生物化学和细胞线粒体生理学研究的团队，他们希望对这种神奇水效应本质进行分析。太田成男曾经研究线粒体功能30多年，越来越多研究发现，活性氧毒性对线粒体功能的破坏效应在衰老和许多慢性病的关系越来越明确，太田教授也逐渐关注这个问题。
2002年，日本Blue Mercury公司社长Wataru Murota(室田涉)先生开始研发铝罐装的富氢水，与此同时和其后，日本多家公司开始富氢水开发生产工作。许多人饮用氢水身体得到不同程度的改善，但是由于缺乏研究证据，这种水的科学性受到学术界内外的质疑，甚至被认为是欺骗。2005年1月，太田成男教授开始用Blue Mercury公司生产的富氢水做实验，作为一种生物化学的标准程序，一般开始用细胞进行效应筛选，然后进行器官效应和整体作用。最早进行的3天细胞学研究发现，添加氢气的培养基具有明显对抗氧化损伤的作用。这个结果让室田先生激动地说：“我昨天还被称做骗子，今天再也不会被人称为骗子了，真的十分感激。”，半年后(2005年6月)，太田成男教授开始用富氢水进行动物疾病模型实验。进行疾病模型研究也是为下一步开展临床试验和应用努力。
无独有偶，日本九州大学的另外一个药理学教授Mami Noda野田麻美也再进行电解水效应的探索。根据野田麻美个人曾经这样描述，“我从事药理学研究超过30年。在洛克菲勒大学作博士后工作结束后，我继续在九州大学工作，九州大学从1997年开始就有学者研究碱性离子水。虽然在市场上有许多错误的信息，这种碱性离子水在日本已经非常流行，我对这个概念一直非常怀疑。但2005年，一个同事给我分享了一个帕金森病患者喝过这种水的一些有趣的数据，这件事促使我开始关注这种水的效应。人们虽然知道氢气可以在碱性离子水电解制造过程中产生，但是不认为氢气具有任何生物学效应，尤其是考虑到氢气在水中的溶解度非常低(饱和度只有0.8mM)。但是我们对这种水的各种成分进行分析后发现，矿物质、pH都不产生这种效应，只有氢气可以表现出这样的效应。2007年，太田成男教授课题组在《自然医学》发表了关于氢气具有选择性抗氧化的学术论文，让我们更加相信这个判断。2009年我们发表了氢气对MPTP诱导小鼠帕金森病模型的改善作用的论文。”请注意，野田麻美2005年开始关注和研究电解水，但此时太田教授已经明确确定了氢气具有抗氧化效应，野田麻美的发现是在2005年和2007年之间，虽然在2007年论文发表前，但显然是晚于太田教授。
从上述线索不难推断，电解水医学效应研究是推动氢气医学的真正思路来源。这一现象的发现是基于最基本的科学发现规范，寻找现象背后的本质的过程。电解水存在多种不同于普通水的特征，例如还原电位、弱碱性、含有一定氢气，最早没有明确具体那种成分发挥作用，只知道有一定作用，但太田等学者的研究，将电解水效应从氢气分子角度提供了最合理的分子基础解释。不过，2007年后日本电解水领域仍然有少数学者坚持活性氢的观点，主要是认为氢气不能完全覆盖电解水的所有效应。例如电解水中氢气含量普遍比较低，而相对保持时间长的电解水仍然存在一定效应，有学者认为电解水中含有极其微量的纳米白金颗粒是其作用的重要基础，这方面最具有代表性的学者是白钿教授。
